本发明公开了一种肿节风SCAR分子鉴定标记的克隆与验证方法,该方法包括以下内容(1)肿节风基因组DNA提取;(2)基因组DNA质量检测;(3)肿节风基因组DNA进行RAPD扩增;(4)肿节风SCAR分子标记的胶回收;(5)肿节风SCAR分子标记的克隆及鉴定;(6)肿节风SCAR分子标记的测序;(7)肿节风鉴定特异性引物的设计;(8)肿节风SCAR分子标记特异引物的验证。本发明通过RAPD扩增技术寻找分子标记物,从分子水平上建立肿节风的特征鉴定指标,即SCAR(Sequence‑characterized amplified region maker,SCAR)分子鉴定标记
本发明的目的在于提供一种基于SCAR标记鉴定坛紫菜品系的方法,即用SCAR标记鉴定坛紫菜“浙东1号”品系,其中SCAR标记的核苷酸序列为SEQ ID NO:1;从SCAR标记上设计的引物的序列为SEQ 本发明采用分子标记技术鉴定坛紫菜“浙东1号”,结果不受环境因素影响,准确可靠;本发明提供的SCAR标记具有操作快速简单、检测结果稳定及成本低廉等优点;本发明提供的SCAR标记法也可应用于坛紫菜其它品系的特异性标记筛查
本发明公开了一种与抗根结线虫基因Me3连锁的SCAR分子标记及其应用,该与抗根结线虫基因Me3连锁的SCAR分子标记含有SEQ ID No:5所示序列;扩增与抗根结线虫基因Me3连锁的SCAR分子标记的引物对的引物本发明所提供的SCAR分子标记可用于分子标记辅助育种,具有特异性强,稳定性高的特点,利用该SCAR分子标记鉴定辣椒是否抗根结线虫病,对底物模板质量的要求不高,且该SCAR分子标记为共显性标记,准确度高,
本发明涉及分子生物学领域,具体地,涉及温室白粉虱特异性SCAR标记、特异性引物及快速分子鉴定方法。本发明的温室白粉虱特异性SCAR标记,所述特异性SCAR标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明还包括与上述温室白粉虱特异性SCAR标记杂交的探针或与其退火的标记引物对。本发明的温室白粉虱快速分子鉴定方法,包括使用上述温室白粉虱特异性SCAR标记探针进行杂交或与其退火的特异性引物进行PCR扩增的步骤。本发明的SCAR分子标记具有重复性好、特异性强、灵敏度高等优点,能够快速准确地鉴定温室白粉虱,且费用低廉。本发明可快速、廉价地进行田间温室白粉虱的快速识别鉴定,对于其田间的针对性防治具有重要意义。
本发明涉及小麦腥黑穗病的病原菌检测,具体涉及用于检测小麦网腥黑粉菌的SCAR标记引物及其应用。本发明提供一种用于鉴定小麦网腥黑粉菌(Tilletia tritici)的SCAR标记,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。还提供用于鉴定小麦网腥黑粉菌(Tilletia tritici)的SCAR标记引物,其核苷酸序列为:Erc19F:5’‑CTTGTCCAAGCACGTACC‑3’;Erc19R:5’‑CTGCGCAGCGAGAGTAG所述SCAR标记引物特异性好、灵敏度高,可准确鉴定小麦网腥黑粉菌。
本发明涉及马铃薯金线虫SCAR标记和LAMP快速检测方法及应用。根据扩增得到马铃薯金线虫的SCAR特异性片段,其核苷酸序列如SEQ ID NO1所示。以此为基础设计了一对特异性引物GrFI和GrRI,获得稳定的SCAR标记,可特异快速检测出马铃薯金线虫。同时根据SCAR片段序列设计了4条LAMP引物GrF3、GrB3、GrFIP和GrBIP;并建立LAMP反应体系,通过提取DNA,等温扩增、扩增产物显色检测,从而快速检测出马铃薯金线虫。本发明的检测方法利用SCAR-PCR和LAMP恒温两种方式均能特异性强、灵敏度高、成本低廉、操作简便,在马铃薯金线虫快速检疫检测方面具有很高的应用价值。